Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFHP12036 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFHP12036 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFHP12036 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFHP12036 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFHP12036 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFHP12036 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFHP12036 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFHP12036 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFHP12036 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFHP12036 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFHP12036 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFHP12036 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFHP12036 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFHP12036 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFHP12036 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFHP12036 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFHP12036 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFHP12036 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFHP12036 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFHP12036 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFHP12036 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEFHP12036 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFHP12036 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFHP12036 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEFHP12036 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEFHP12036 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFHP12036 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFHP12036 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEFHP12036 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFHP12036 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFHP12036 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFHP12036 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFHP12036 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFHP12036 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFHP12036 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFHP12036 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFHP12036 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFHP12036 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFHP12036 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFHP12036 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFHP12036 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFHP12036 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFHP12036 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFHP12036 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFHP12036 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFHP12036 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFHP12036 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFHP12036 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFHP12036 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEFHP12036 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEFHP12036 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFHP12036 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFHP12036 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEFHP12036 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFHP12036 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFHP12036 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFHP12036 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFHP12036 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFHP12036 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFHP12036 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFHP12036 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFHP12036 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFHP12036 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFHP12036 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFHP12036 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFHP12036 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFHP12036 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFHP12036 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFHP12036 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFHP12036 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFHP12036 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEFHP12036 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEFHP12036 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFHP12036 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEFHP12036 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEFHP12036 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFHP12036 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEFHP12036 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEFHP12036 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFHP12036 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFHP12036 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFHP12036 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFHP12036 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFHP12036 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFHP12036 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFHP12036 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFHP12036 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFHP12036 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFHP12036 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFHP12036 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFHP12036 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFHP12036 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFHP12036 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFHP12036 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFHP12036 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFHP12036 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFHP12036 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFHP12036 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFHP12036 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms