Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CHRM1P11229 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHRM1P11229 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CHRM1P11229 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHRM1P11229 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHRM1P11229 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHRM1P11229 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRM1P11229 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRM1P11229 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRM1P11229 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRM1P11229 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHRM1P11229 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHRM1P11229 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRM1P11229 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRM1P11229 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRM1P11229 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHRM1P11229 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRM1P11229 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRM1P11229 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRM1P11229 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRM1P11229 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRM1P11229 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRM1P11229 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHRM1P11229 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRM1P11229 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRM1P11229 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRM1P11229 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRM1P11229 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRM1P11229 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRM1P11229 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRM1P11229 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHRM1P11229 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHRM1P11229 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CHRM1P11229 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRM1P11229 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRM1P11229 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRM1P11229 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRM1P11229 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRM1P11229 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRM1P11229 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRM1P11229 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRM1P11229 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRM1P11229 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRM1P11229 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRM1P11229 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRM1P11229 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRM1P11229 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRM1P11229 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRM1P11229 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRM1P11229 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRM1P11229 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRM1P11229 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRM1P11229 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRM1P11229 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRM1P11229 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRM1P11229 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRM1P11229 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRM1P11229 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRM1P11229 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRM1P11229 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRM1P11229 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRM1P11229 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRM1P11229 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRM1P11229 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRM1P11229 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRM1P11229 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRM1P11229 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRM1P11229 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRM1P11229 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRM1P11229 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRM1P11229 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRM1P11229 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRM1P11229 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRM1P11229 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRM1P11229 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRM1P11229 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRM1P11229 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRM1P11229 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRM1P11229 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRM1P11229 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRM1P11229 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRM1P11229 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CHRM1P11229 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRM1P11229 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRM1P11229 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRM1P11229 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRM1P11229 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRM1P11229 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRM1P11229 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRM1P11229 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms