Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PF4V1P10720 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PF4V1P10720 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PF4V1P10720 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PF4V1P10720 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PF4V1P10720 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PF4V1P10720 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PF4V1P10720 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PF4V1P10720 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PF4V1P10720 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PF4V1P10720 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PF4V1P10720 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PF4V1P10720 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PF4V1P10720 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PF4V1P10720 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PF4V1P10720 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PF4V1P10720 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PF4V1P10720 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PF4V1P10720 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PF4V1P10720 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PF4V1P10720 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PF4V1P10720 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PF4V1P10720 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PF4V1P10720 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PF4V1P10720 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PF4V1P10720 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PF4V1P10720 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PF4V1P10720 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PF4V1P10720 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PF4V1P10720 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PF4V1P10720 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PF4V1P10720 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PF4V1P10720 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PF4V1P10720 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PF4V1P10720 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PF4V1P10720 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PF4V1P10720 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PF4V1P10720 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PF4V1P10720 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PF4V1P10720 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PF4V1P10720 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PF4V1P10720 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PF4V1P10720 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PF4V1P10720 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PF4V1P10720 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PF4V1P10720 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PF4V1P10720 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PF4V1P10720 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PF4V1P10720 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PF4V1P10720 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PF4V1P10720 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PF4V1P10720 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PF4V1P10720 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PF4V1P10720 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PF4V1P10720 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PF4V1P10720 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PF4V1P10720 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PF4V1P10720 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PF4V1P10720 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PF4V1P10720 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PF4V1P10720 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PF4V1P10720 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PF4V1P10720 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PF4V1P10720 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PF4V1P10720 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PF4V1P10720 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PF4V1P10720 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PF4V1P10720 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PF4V1P10720 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms