Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB5P09067 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB5P09067 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB5P09067 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB5P09067 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB5P09067 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB5P09067 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB5P09067 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXB5P09067 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB5P09067 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB5P09067 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB5P09067 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB5P09067 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB5P09067 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB5P09067 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB5P09067 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB5P09067 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB5P09067 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB5P09067 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB5P09067 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB5P09067 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB5P09067 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB5P09067 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB5P09067 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB5P09067 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB5P09067 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB5P09067 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB5P09067 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB5P09067 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB5P09067 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB5P09067 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB5P09067 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB5P09067 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB5P09067 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB5P09067 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB5P09067 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB5P09067 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB5P09067 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB5P09067 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB5P09067 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB5P09067 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB5P09067 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB5P09067 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB5P09067 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB5P09067 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB5P09067 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB5P09067 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB5P09067 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB5P09067 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB5P09067 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB5P09067 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB5P09067 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB5P09067 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB5P09067 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB5P09067 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB5P09067 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB5P09067 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB5P09067 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB5P09067 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB5P09067 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB5P09067 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB5P09067 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB5P09067 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB5P09067 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB5P09067 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB5P09067 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB5P09067 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB5P09067 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB5P09067 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB5P09067 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB5P09067 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms