Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
POLR3DP05423 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
POLR3DP05423 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLR3DP05423 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
POLR3DP05423 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLR3DP05423 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
POLR3DP05423 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
POLR3DP05423 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
POLR3DP05423 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLR3DP05423 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLR3DP05423 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLR3DP05423 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLR3DP05423 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
POLR3DP05423 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
POLR3DP05423 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
POLR3DP05423 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
POLR3DP05423 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
POLR3DP05423 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3DP05423 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR3DP05423 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
POLR3DP05423 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR3DP05423 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
POLR3DP05423 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
POLR3DP05423 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR3DP05423 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
POLR3DP05423 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
POLR3DP05423 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
POLR3DP05423 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
POLR3DP05423 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
POLR3DP05423 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
POLR3DP05423 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
POLR3DP05423 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
POLR3DP05423 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR3DP05423 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR3DP05423 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3DP05423 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3DP05423 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3DP05423 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR3DP05423 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLR3DP05423 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR3DP05423 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR3DP05423 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLR3DP05423 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR3DP05423 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLR3DP05423 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3DP05423 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3DP05423 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
POLR3DP05423 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR3DP05423 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR3DP05423 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR3DP05423 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLR3DP05423 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR3DP05423 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR3DP05423 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR3DP05423 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR3DP05423 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR3DP05423 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLR3DP05423 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
POLR3DP05423 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLR3DP05423 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
POLR3DP05423 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR3DP05423 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR3DP05423 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3DP05423 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR3DP05423 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLR3DP05423 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLR3DP05423 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLR3DP05423 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR3DP05423 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR3DP05423 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR3DP05423 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLR3DP05423 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLR3DP05423 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLR3DP05423 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLR3DP05423 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR3DP05423 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3DP05423 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLR3DP05423 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLR3DP05423 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR3DP05423 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR3DP05423 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLR3DP05423 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR3DP05423 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR3DP05423 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLR3DP05423 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR3DP05423 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR3DP05423 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR3DP05423 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR3DP05423 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR3DP05423 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
POLR3DP05423 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLR3DP05423 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
POLR3DP05423 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLR3DP05423 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR3DP05423 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR3DP05423 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR3DP05423 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLR3DP05423 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLR3DP05423 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR3DP05423 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms