Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYMSP04818 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYMSP04818 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TYMSP04818 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TYMSP04818 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYMSP04818 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYMSP04818 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYMSP04818 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYMSP04818 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYMSP04818 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TYMSP04818 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TYMSP04818 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYMSP04818 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TYMSP04818 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYMSP04818 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYMSP04818 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYMSP04818 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYMSP04818 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYMSP04818 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYMSP04818 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYMSP04818 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYMSP04818 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYMSP04818 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYMSP04818 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYMSP04818 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYMSP04818 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYMSP04818 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TYMSP04818 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TYMSP04818 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TYMSP04818 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TYMSP04818 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYMSP04818 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TYMSP04818 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYMSP04818 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYMSP04818 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYMSP04818 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYMSP04818 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYMSP04818 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYMSP04818 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYMSP04818 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYMSP04818 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TYMSP04818 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYMSP04818 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYMSP04818 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYMSP04818 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYMSP04818 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYMSP04818 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TYMSP04818 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYMSP04818 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TYMSP04818 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TYMSP04818 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TYMSP04818 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYMSP04818 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TYMSP04818 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYMSP04818 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYMSP04818 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYMSP04818 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYMSP04818 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYMSP04818 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYMSP04818 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYMSP04818 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYMSP04818 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TYMSP04818 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYMSP04818 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYMSP04818 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYMSP04818 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TYMSP04818 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYMSP04818 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TYMSP04818 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TYMSP04818 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TYMSP04818 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYMSP04818 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYMSP04818 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYMSP04818 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYMSP04818 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYMSP04818 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TYMSP04818 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TYMSP04818 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TYMSP04818 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TYMSP04818 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TYMSP04818 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TYMSP04818 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYMSP04818 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYMSP04818 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TYMSP04818 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYMSP04818 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TYMSP04818 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TYMSP04818 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TYMSP04818 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TYMSP04818 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TYMSP04818 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TYMSP04818 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TYMSP04818 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TYMSP04818 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TYMSP04818 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TYMSP04818 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TYMSP04818 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TYMSP04818 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TYMSP04818 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TYMSP04818 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms