Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRM2P04554 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRM2P04554 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRM2P04554 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRM2P04554 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRM2P04554 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRM2P04554 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM2P04554 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM2P04554 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM2P04554 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM2P04554 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM2P04554 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM2P04554 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM2P04554 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM2P04554 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM2P04554 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM2P04554 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM2P04554 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM2P04554 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM2P04554 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM2P04554 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRM2P04554 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRM2P04554 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRM2P04554 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRM2P04554 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRM2P04554 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRM2P04554 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRM2P04554 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRM2P04554 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRM2P04554 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRM2P04554 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRM2P04554 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRM2P04554 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRM2P04554 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRM2P04554 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRM2P04554 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRM2P04554 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRM2P04554 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRM2P04554 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PRM2P04554 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRM2P04554 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRM2P04554 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRM2P04554 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRM2P04554 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRM2P04554 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRM2P04554 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRM2P04554 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRM2P04554 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRM2P04554 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRM2P04554 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRM2P04554 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRM2P04554 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRM2P04554 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRM2P04554 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRM2P04554 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRM2P04554 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRM2P04554 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRM2P04554 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRM2P04554 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRM2P04554 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRM2P04554 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRM2P04554 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRM2P04554 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRM2P04554 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRM2P04554 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRM2P04554 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRM2P04554 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRM2P04554 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRM2P04554 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRM2P04554 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRM2P04554 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRM2P04554 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRM2P04554 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRM2P04554 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRM2P04554 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRM2P04554 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRM2P04554 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRM2P04554 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRM2P04554 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRM2P04554 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRM2P04554 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRM2P04554 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRM2P04554 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRM2P04554 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRM2P04554 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRM2P04554 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRM2P04554 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRM2P04554 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRM2P04554 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRM2P04554 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRM2P04554 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRM2P04554 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRM2P04554 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRM2P04554 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRM2P04554 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRM2P04554 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRM2P04554 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRM2P04554 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRM2P04554 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRM2P04554 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms