Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MT-ND3P03897 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MT-ND3P03897 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MT-ND3P03897 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MT-ND3P03897 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MT-ND3P03897 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MT-ND3P03897 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MT-ND3P03897 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MT-ND3P03897 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MT-ND3P03897 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MT-ND3P03897 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MT-ND3P03897 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MT-ND3P03897 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MT-ND3P03897 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MT-ND3P03897 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MT-ND3P03897 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MT-ND3P03897 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MT-ND3P03897 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MT-ND3P03897 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MT-ND3P03897 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MT-ND3P03897 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MT-ND3P03897 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MT-ND3P03897 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MT-ND3P03897 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MT-ND3P03897 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MT-ND3P03897 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MT-ND3P03897 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MT-ND3P03897 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MT-ND3P03897 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MT-ND3P03897 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MT-ND3P03897 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MT-ND3P03897 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MT-ND3P03897 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MT-ND3P03897 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MT-ND3P03897 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MT-ND3P03897 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MT-ND3P03897 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MT-ND3P03897 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MT-ND3P03897 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MT-ND3P03897 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MT-ND3P03897 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MT-ND3P03897 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MT-ND3P03897 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MT-ND3P03897 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MT-ND3P03897 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MT-ND3P03897 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MT-ND3P03897 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MT-ND3P03897 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MT-ND3P03897 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MT-ND3P03897 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MT-ND3P03897 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MT-ND3P03897 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MT-ND3P03897 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MT-ND3P03897 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MT-ND3P03897 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MT-ND3P03897 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MT-ND3P03897 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MT-ND3P03897 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MT-ND3P03897 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MT-ND3P03897 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MT-ND3P03897 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MT-ND3P03897 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MT-ND3P03897 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MT-ND3P03897 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MT-ND3P03897 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MT-ND3P03897 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MT-ND3P03897 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MT-ND3P03897 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MT-ND3P03897 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MT-ND3P03897 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MT-ND3P03897 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MT-ND3P03897 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MT-ND3P03897 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MT-ND3P03897 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MT-ND3P03897 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MT-ND3P03897 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MT-ND3P03897 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MT-ND3P03897 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MT-ND3P03897 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MT-ND3P03897 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MT-ND3P03897 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MT-ND3P03897 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MT-ND3P03897 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MT-ND3P03897 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MT-ND3P03897 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MT-ND3P03897 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MT-ND3P03897 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MT-ND3P03897 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MT-ND3P03897 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MT-ND3P03897 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MT-ND3P03897 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms