Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHV3-7P01780 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHV3-7P01780 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHV3-7P01780 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHV3-7P01780 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV3-7P01780 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGHV3-7P01780 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHV3-7P01780 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHV3-7P01780 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-7P01780 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-7P01780 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-7P01780 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHV3-7P01780 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV3-7P01780 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-7P01780 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-7P01780 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IGHV3-7P01780 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-7P01780 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV3-7P01780 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-7P01780 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHV3-7P01780 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-7P01780 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-7P01780 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-7P01780 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV3-7P01780 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV3-7P01780 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV3-7P01780 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-7P01780 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-7P01780 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV3-7P01780 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV3-7P01780 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV3-7P01780 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV3-7P01780 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV3-7P01780 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV3-7P01780 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV3-7P01780 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-7P01780 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-7P01780 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-7P01780 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-7P01780 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-7P01780 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-7P01780 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-7P01780 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-7P01780 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-7P01780 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-7P01780 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-7P01780 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-7P01780 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-7P01780 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-7P01780 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-7P01780 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHV3-7P01780 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV3-7P01780 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-7P01780 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-7P01780 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV3-7P01780 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV3-7P01780 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV3-7P01780 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-7P01780 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-7P01780 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-7P01780 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-7P01780 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-7P01780 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-7P01780 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-7P01780 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-7P01780 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms