Protein–RNA interactions for Protein: P01594

IGKV1-33, Immunoglobulin kappa variable 1-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-33P01594 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV1-33P01594 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGKV1-33P01594 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1-33P01594 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGKV1-33P01594 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV1-33P01594 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1-33P01594 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1-33P01594 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV1-33P01594 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV1-33P01594 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV1-33P01594 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV1-33P01594 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV1-33P01594 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV1-33P01594 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV1-33P01594 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV1-33P01594 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV1-33P01594 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGKV1-33P01594 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV1-33P01594 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV1-33P01594 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGKV1-33P01594 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGKV1-33P01594 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV1-33P01594 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV1-33P01594 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGKV1-33P01594 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGKV1-33P01594 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGKV1-33P01594 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGKV1-33P01594 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGKV1-33P01594 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV1-33P01594 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV1-33P01594 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGKV1-33P01594 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGKV1-33P01594 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGKV1-33P01594 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGKV1-33P01594 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1-33P01594 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1-33P01594 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1-33P01594 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1-33P01594 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IGKV1-33P01594 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1-33P01594 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV1-33P01594 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1-33P01594 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1-33P01594 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1-33P01594 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1-33P01594 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV1-33P01594 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1-33P01594 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1-33P01594 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1-33P01594 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-33P01594 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-33P01594 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-33P01594 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-33P01594 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1-33P01594 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-33P01594 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-33P01594 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms