Protein–RNA interactions for Protein: O95782

AP2A1, AP-2 complex subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2A1O95782 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AP2A1O95782 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP2A1O95782 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP2A1O95782 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP2A1O95782 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AP2A1O95782 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AP2A1O95782 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AP2A1O95782 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
AP2A1O95782 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AP2A1O95782 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AP2A1O95782 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AP2A1O95782 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AP2A1O95782 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AP2A1O95782 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AP2A1O95782 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AP2A1O95782 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AP2A1O95782 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AP2A1O95782 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AP2A1O95782 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AP2A1O95782 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
AP2A1O95782 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AP2A1O95782 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AP2A1O95782 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP2A1O95782 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP2A1O95782 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP2A1O95782 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
AP2A1O95782 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AP2A1O95782 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AP2A1O95782 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP2A1O95782 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AP2A1O95782 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP2A1O95782 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP2A1O95782 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AP2A1O95782 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AP2A1O95782 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AP2A1O95782 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP2A1O95782 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AP2A1O95782 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP2A1O95782 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP2A1O95782 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP2A1O95782 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP2A1O95782 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP2A1O95782 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP2A1O95782 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AP2A1O95782 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AP2A1O95782 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP2A1O95782 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP2A1O95782 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP2A1O95782 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP2A1O95782 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP2A1O95782 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP2A1O95782 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP2A1O95782 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP2A1O95782 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP2A1O95782 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AP2A1O95782 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP2A1O95782 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP2A1O95782 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP2A1O95782 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP2A1O95782 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP2A1O95782 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP2A1O95782 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP2A1O95782 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP2A1O95782 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP2A1O95782 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP2A1O95782 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP2A1O95782 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP2A1O95782 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP2A1O95782 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP2A1O95782 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP2A1O95782 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP2A1O95782 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms