Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4BO94953 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4BO94953 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4BO94953 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4BO94953 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4BO94953 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4BO94953 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4BO94953 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM4BO94953 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4BO94953 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM4BO94953 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4BO94953 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4BO94953 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4BO94953 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4BO94953 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4BO94953 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4BO94953 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM4BO94953 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4BO94953 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4BO94953 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4BO94953 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4BO94953 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4BO94953 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4BO94953 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4BO94953 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4BO94953 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4BO94953 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4BO94953 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4BO94953 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4BO94953 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4BO94953 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4BO94953 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4BO94953 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4BO94953 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4BO94953 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4BO94953 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4BO94953 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4BO94953 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4BO94953 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4BO94953 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4BO94953 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4BO94953 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4BO94953 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4BO94953 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4BO94953 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4BO94953 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM4BO94953 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM4BO94953 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM4BO94953 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4BO94953 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM4BO94953 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4BO94953 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4BO94953 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4BO94953 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4BO94953 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4BO94953 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4BO94953 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4BO94953 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4BO94953 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4BO94953 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4BO94953 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4BO94953 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4BO94953 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM4BO94953 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM4BO94953 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4BO94953 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM4BO94953 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM4BO94953 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM4BO94953 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM4BO94953 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM4BO94953 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM4BO94953 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM4BO94953 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM4BO94953 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM4BO94953 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM4BO94953 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM4BO94953 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4BO94953 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4BO94953 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4BO94953 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4BO94953 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4BO94953 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4BO94953 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4BO94953 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4BO94953 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4BO94953 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4BO94953 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4BO94953 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms