Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PALMO75781 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PALMO75781 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PALMO75781 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PALMO75781 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PALMO75781 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PALMO75781 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PALMO75781 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PALMO75781 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PALMO75781 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PALMO75781 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PALMO75781 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PALMO75781 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PALMO75781 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PALMO75781 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PALMO75781 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PALMO75781 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PALMO75781 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PALMO75781 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PALMO75781 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PALMO75781 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PALMO75781 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PALMO75781 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PALMO75781 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PALMO75781 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PALMO75781 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PALMO75781 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PALMO75781 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PALMO75781 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALMO75781 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALMO75781 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALMO75781 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PALMO75781 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PALMO75781 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PALMO75781 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PALMO75781 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PALMO75781 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PALMO75781 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PALMO75781 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PALMO75781 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PALMO75781 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PALMO75781 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PALMO75781 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PALMO75781 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PALMO75781 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PALMO75781 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PALMO75781 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PALMO75781 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PALMO75781 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PALMO75781 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PALMO75781 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PALMO75781 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PALMO75781 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PALMO75781 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PALMO75781 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PALMO75781 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PALMO75781 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PALMO75781 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PALMO75781 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PALMO75781 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PALMO75781 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PALMO75781 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PALMO75781 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PALMO75781 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PALMO75781 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PALMO75781 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PALMO75781 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PALMO75781 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PALMO75781 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PALMO75781 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PALMO75781 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PALMO75781 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PALMO75781 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PALMO75781 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PALMO75781 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PALMO75781 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PALMO75781 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PALMO75781 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PALMO75781 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PALMO75781 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PALMO75781 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PALMO75781 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PALMO75781 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PALMO75781 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PALMO75781 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PALMO75781 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PALMO75781 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PALMO75781 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PALMO75781 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PALMO75781 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PALMO75781 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PALMO75781 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PALMO75781 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PALMO75781 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PALMO75781 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PALMO75781 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PALMO75781 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PALMO75781 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PALMO75781 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PALMO75781 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms