Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC43A1O75387 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC43A1O75387 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC43A1O75387 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC43A1O75387 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC43A1O75387 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC43A1O75387 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC43A1O75387 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC43A1O75387 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC43A1O75387 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC43A1O75387 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC43A1O75387 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC43A1O75387 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC43A1O75387 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC43A1O75387 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC43A1O75387 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC43A1O75387 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC43A1O75387 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC43A1O75387 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC43A1O75387 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC43A1O75387 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC43A1O75387 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC43A1O75387 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC43A1O75387 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC43A1O75387 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC43A1O75387 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC43A1O75387 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC43A1O75387 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC43A1O75387 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC43A1O75387 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC43A1O75387 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC43A1O75387 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC43A1O75387 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC43A1O75387 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC43A1O75387 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC43A1O75387 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC43A1O75387 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC43A1O75387 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC43A1O75387 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC43A1O75387 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC43A1O75387 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC43A1O75387 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC43A1O75387 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC43A1O75387 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC43A1O75387 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC43A1O75387 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC43A1O75387 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC43A1O75387 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC43A1O75387 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC43A1O75387 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC43A1O75387 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC43A1O75387 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC43A1O75387 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC43A1O75387 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC43A1O75387 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC43A1O75387 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC43A1O75387 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC43A1O75387 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC43A1O75387 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC43A1O75387 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC43A1O75387 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC43A1O75387 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC43A1O75387 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC43A1O75387 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC43A1O75387 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC43A1O75387 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC43A1O75387 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC43A1O75387 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC43A1O75387 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC43A1O75387 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC43A1O75387 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC43A1O75387 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC43A1O75387 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms