Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF2O60811 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF2O60811 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF2O60811 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF2O60811 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF2O60811 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF2O60811 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF2O60811 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF2O60811 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF2O60811 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF2O60811 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF2O60811 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF2O60811 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF2O60811 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF2O60811 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF2O60811 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRAMEF2O60811 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF2O60811 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF2O60811 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF2O60811 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF2O60811 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF2O60811 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF2O60811 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF2O60811 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF2O60811 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF2O60811 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF2O60811 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF2O60811 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF2O60811 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF2O60811 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF2O60811 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF2O60811 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF2O60811 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF2O60811 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF2O60811 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF2O60811 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF2O60811 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF2O60811 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF2O60811 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF2O60811 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF2O60811 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF2O60811 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF2O60811 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF2O60811 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF2O60811 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF2O60811 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF2O60811 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF2O60811 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF2O60811 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF2O60811 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF2O60811 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF2O60811 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF2O60811 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF2O60811 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF2O60811 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF2O60811 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF2O60811 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF2O60811 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF2O60811 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF2O60811 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF2O60811 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF2O60811 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF2O60811 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF2O60811 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF2O60811 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF2O60811 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF2O60811 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF2O60811 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF2O60811 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF2O60811 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF2O60811 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF2O60811 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF2O60811 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF2O60811 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF2O60811 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF2O60811 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF2O60811 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF2O60811 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF2O60811 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF2O60811 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF2O60811 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF2O60811 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF2O60811 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF2O60811 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF2O60811 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF2O60811 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF2O60811 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF2O60811 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF2O60811 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF2O60811 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms