Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHST1O43916 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHST1O43916 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST1O43916 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST1O43916 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST1O43916 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST1O43916 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST1O43916 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST1O43916 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST1O43916 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST1O43916 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST1O43916 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST1O43916 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST1O43916 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST1O43916 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHST1O43916 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHST1O43916 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST1O43916 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST1O43916 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST1O43916 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST1O43916 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST1O43916 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHST1O43916 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST1O43916 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST1O43916 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST1O43916 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST1O43916 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST1O43916 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST1O43916 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST1O43916 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST1O43916 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST1O43916 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST1O43916 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST1O43916 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST1O43916 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST1O43916 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHST1O43916 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST1O43916 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST1O43916 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST1O43916 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST1O43916 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST1O43916 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST1O43916 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST1O43916 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST1O43916 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST1O43916 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST1O43916 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST1O43916 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST1O43916 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST1O43916 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST1O43916 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST1O43916 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHST1O43916 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST1O43916 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST1O43916 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST1O43916 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST1O43916 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST1O43916 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST1O43916 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST1O43916 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST1O43916 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST1O43916 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST1O43916 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST1O43916 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST1O43916 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST1O43916 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST1O43916 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST1O43916 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST1O43916 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST1O43916 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST1O43916 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST1O43916 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST1O43916 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST1O43916 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST1O43916 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST1O43916 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST1O43916 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST1O43916 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST1O43916 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST1O43916 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST1O43916 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST1O43916 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST1O43916 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST1O43916 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST1O43916 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST1O43916 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST1O43916 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST1O43916 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST1O43916 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST1O43916 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST1O43916 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST1O43916 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST1O43916 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHST1O43916 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHST1O43916 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST1O43916 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST1O43916 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST1O43916 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST1O43916 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST1O43916 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms