Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP9O43818 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP9O43818 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP9O43818 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP9O43818 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP9O43818 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP9O43818 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP9O43818 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP9O43818 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP9O43818 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP9O43818 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP9O43818 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP9O43818 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP9O43818 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP9O43818 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP9O43818 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP9O43818 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP9O43818 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP9O43818 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RRP9O43818 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RRP9O43818 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RRP9O43818 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RRP9O43818 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RRP9O43818 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RRP9O43818 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RRP9O43818 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP9O43818 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP9O43818 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RRP9O43818 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP9O43818 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RRP9O43818 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRP9O43818 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP9O43818 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP9O43818 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
RRP9O43818 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRP9O43818 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRP9O43818 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRP9O43818 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP9O43818 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP9O43818 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP9O43818 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP9O43818 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP9O43818 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP9O43818 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP9O43818 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP9O43818 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP9O43818 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP9O43818 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP9O43818 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP9O43818 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP9O43818 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP9O43818 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP9O43818 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP9O43818 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP9O43818 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP9O43818 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP9O43818 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP9O43818 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP9O43818 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP9O43818 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP9O43818 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP9O43818 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP9O43818 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RRP9O43818 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP9O43818 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RRP9O43818 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RRP9O43818 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RRP9O43818 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP9O43818 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP9O43818 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP9O43818 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRP9O43818 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP9O43818 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP9O43818 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP9O43818 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP9O43818 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP9O43818 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP9O43818 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP9O43818 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP9O43818 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP9O43818 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP9O43818 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP9O43818 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP9O43818 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP9O43818 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP9O43818 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP9O43818 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP9O43818 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RRP9O43818 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRP9O43818 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRP9O43818 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP9O43818 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP9O43818 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRP9O43818 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRP9O43818 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP9O43818 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP9O43818 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP9O43818 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRP9O43818 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP9O43818 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms