Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BUD23O43709 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BUD23O43709 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BUD23O43709 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BUD23O43709 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BUD23O43709 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BUD23O43709 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BUD23O43709 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BUD23O43709 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BUD23O43709 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BUD23O43709 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BUD23O43709 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BUD23O43709 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BUD23O43709 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BUD23O43709 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BUD23O43709 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BUD23O43709 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BUD23O43709 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BUD23O43709 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BUD23O43709 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BUD23O43709 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BUD23O43709 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BUD23O43709 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BUD23O43709 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BUD23O43709 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BUD23O43709 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BUD23O43709 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BUD23O43709 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BUD23O43709 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BUD23O43709 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BUD23O43709 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BUD23O43709 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BUD23O43709 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BUD23O43709 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BUD23O43709 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BUD23O43709 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BUD23O43709 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BUD23O43709 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BUD23O43709 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BUD23O43709 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BUD23O43709 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BUD23O43709 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUD23O43709 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUD23O43709 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUD23O43709 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BUD23O43709 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BUD23O43709 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BUD23O43709 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BUD23O43709 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BUD23O43709 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BUD23O43709 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BUD23O43709 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BUD23O43709 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BUD23O43709 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BUD23O43709 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BUD23O43709 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BUD23O43709 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BUD23O43709 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BUD23O43709 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BUD23O43709 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BUD23O43709 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BUD23O43709 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BUD23O43709 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BUD23O43709 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BUD23O43709 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BUD23O43709 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BUD23O43709 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BUD23O43709 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BUD23O43709 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BUD23O43709 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BUD23O43709 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BUD23O43709 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BUD23O43709 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BUD23O43709 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BUD23O43709 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BUD23O43709 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BUD23O43709 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BUD23O43709 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BUD23O43709 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BUD23O43709 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BUD23O43709 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BUD23O43709 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BUD23O43709 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BUD23O43709 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BUD23O43709 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BUD23O43709 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BUD23O43709 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BUD23O43709 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BUD23O43709 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BUD23O43709 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BUD23O43709 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BUD23O43709 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BUD23O43709 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BUD23O43709 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BUD23O43709 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms