Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF13O43567 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF13O43567 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF13O43567 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF13O43567 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF13O43567 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF13O43567 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF13O43567 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF13O43567 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF13O43567 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF13O43567 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF13O43567 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF13O43567 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF13O43567 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF13O43567 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF13O43567 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF13O43567 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF13O43567 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF13O43567 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF13O43567 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF13O43567 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF13O43567 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF13O43567 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF13O43567 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF13O43567 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF13O43567 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF13O43567 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF13O43567 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF13O43567 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF13O43567 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF13O43567 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF13O43567 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF13O43567 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF13O43567 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF13O43567 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF13O43567 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF13O43567 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF13O43567 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF13O43567 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF13O43567 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF13O43567 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF13O43567 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF13O43567 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF13O43567 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF13O43567 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF13O43567 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF13O43567 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF13O43567 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF13O43567 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF13O43567 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF13O43567 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF13O43567 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF13O43567 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF13O43567 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF13O43567 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF13O43567 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF13O43567 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF13O43567 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF13O43567 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF13O43567 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF13O43567 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF13O43567 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF13O43567 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF13O43567 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF13O43567 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF13O43567 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF13O43567 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF13O43567 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF13O43567 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF13O43567 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF13O43567 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF13O43567 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF13O43567 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF13O43567 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF13O43567 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF13O43567 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF13O43567 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF13O43567 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF13O43567 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF13O43567 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF13O43567 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF13O43567 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF13O43567 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF13O43567 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF13O43567 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF13O43567 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF13O43567 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF13O43567 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF13O43567 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF13O43567 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF13O43567 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF13O43567 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF13O43567 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF13O43567 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF13O43567 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF13O43567 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF13O43567 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF13O43567 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF13O43567 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF13O43567 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms