Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC7A4O43246 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC7A4O43246 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC7A4O43246 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC7A4O43246 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC7A4O43246 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC7A4O43246 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC7A4O43246 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC7A4O43246 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC7A4O43246 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC7A4O43246 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC7A4O43246 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC7A4O43246 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC7A4O43246 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC7A4O43246 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC7A4O43246 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC7A4O43246 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC7A4O43246 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC7A4O43246 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC7A4O43246 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC7A4O43246 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC7A4O43246 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC7A4O43246 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC7A4O43246 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC7A4O43246 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC7A4O43246 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC7A4O43246 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC7A4O43246 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC7A4O43246 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC7A4O43246 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC7A4O43246 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC7A4O43246 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC7A4O43246 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC7A4O43246 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC7A4O43246 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC7A4O43246 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC7A4O43246 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC7A4O43246 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC7A4O43246 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC7A4O43246 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC7A4O43246 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC7A4O43246 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC7A4O43246 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC7A4O43246 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC7A4O43246 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC7A4O43246 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC7A4O43246 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC7A4O43246 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC7A4O43246 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC7A4O43246 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC7A4O43246 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC7A4O43246 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC7A4O43246 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC7A4O43246 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC7A4O43246 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC7A4O43246 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC7A4O43246 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC7A4O43246 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC7A4O43246 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC7A4O43246 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC7A4O43246 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC7A4O43246 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC7A4O43246 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC7A4O43246 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC7A4O43246 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC7A4O43246 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC7A4O43246 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC7A4O43246 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC7A4O43246 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC7A4O43246 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC7A4O43246 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC7A4O43246 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC7A4O43246 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC7A4O43246 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC7A4O43246 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC7A4O43246 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC7A4O43246 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC7A4O43246 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC7A4O43246 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC7A4O43246 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC7A4O43246 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC7A4O43246 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC7A4O43246 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC7A4O43246 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC7A4O43246 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC7A4O43246 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC7A4O43246 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC7A4O43246 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC7A4O43246 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC7A4O43246 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC7A4O43246 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms