Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA4O00629 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KPNA4O00629 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KPNA4O00629 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KPNA4O00629 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA4O00629 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KPNA4O00629 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KPNA4O00629 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KPNA4O00629 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KPNA4O00629 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KPNA4O00629 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KPNA4O00629 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KPNA4O00629 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KPNA4O00629 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KPNA4O00629 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KPNA4O00629 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KPNA4O00629 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KPNA4O00629 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KPNA4O00629 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KPNA4O00629 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KPNA4O00629 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KPNA4O00629 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KPNA4O00629 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KPNA4O00629 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA4O00629 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KPNA4O00629 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KPNA4O00629 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KPNA4O00629 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA4O00629 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA4O00629 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA4O00629 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA4O00629 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA4O00629 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA4O00629 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KPNA4O00629 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KPNA4O00629 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KPNA4O00629 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KPNA4O00629 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KPNA4O00629 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KPNA4O00629 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KPNA4O00629 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KPNA4O00629 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KPNA4O00629 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KPNA4O00629 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KPNA4O00629 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KPNA4O00629 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KPNA4O00629 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KPNA4O00629 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KPNA4O00629 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KPNA4O00629 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KPNA4O00629 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KPNA4O00629 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KPNA4O00629 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KPNA4O00629 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KPNA4O00629 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KPNA4O00629 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KPNA4O00629 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KPNA4O00629 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KPNA4O00629 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KPNA4O00629 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KPNA4O00629 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KPNA4O00629 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KPNA4O00629 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KPNA4O00629 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KPNA4O00629 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KPNA4O00629 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KPNA4O00629 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KPNA4O00629 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KPNA4O00629 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KPNA4O00629 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KPNA4O00629 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KPNA4O00629 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KPNA4O00629 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KPNA4O00629 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA4O00629 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA4O00629 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA4O00629 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA4O00629 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA4O00629 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KPNA4O00629 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KPNA4O00629 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA4O00629 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA4O00629 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA4O00629 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA4O00629 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms