Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRNO00468 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRNO00468 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRNO00468 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRNO00468 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGRNO00468 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRNO00468 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGRNO00468 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGRNO00468 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGRNO00468 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGRNO00468 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGRNO00468 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGRNO00468 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGRNO00468 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGRNO00468 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGRNO00468 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGRNO00468 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGRNO00468 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGRNO00468 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AGRNO00468 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AGRNO00468 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AGRNO00468 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGRNO00468 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AGRNO00468 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGRNO00468 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGRNO00468 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGRNO00468 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGRNO00468 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGRNO00468 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGRNO00468 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGRNO00468 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGRNO00468 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGRNO00468 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AGRNO00468 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AGRNO00468 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AGRNO00468 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AGRNO00468 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGRNO00468 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AGRNO00468 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AGRNO00468 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AGRNO00468 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGRNO00468 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGRNO00468 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGRNO00468 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGRNO00468 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGRNO00468 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGRNO00468 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGRNO00468 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AGRNO00468 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGRNO00468 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGRNO00468 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGRNO00468 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGRNO00468 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGRNO00468 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGRNO00468 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGRNO00468 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGRNO00468 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGRNO00468 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGRNO00468 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AGRNO00468 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGRNO00468 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGRNO00468 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AGRNO00468 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AGRNO00468 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AGRNO00468 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGRNO00468 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGRNO00468 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGRNO00468 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGRNO00468 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGRNO00468 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGRNO00468 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGRNO00468 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGRNO00468 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGRNO00468 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGRNO00468 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGRNO00468 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGRNO00468 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGRNO00468 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGRNO00468 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGRNO00468 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGRNO00468 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGRNO00468 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGRNO00468 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGRNO00468 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGRNO00468 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGRNO00468 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AGRNO00468 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AGRNO00468 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AGRNO00468 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AGRNO00468 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AGRNO00468 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AGRNO00468 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AGRNO00468 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AGRNO00468 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AGRNO00468 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AGRNO00468 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AGRNO00468 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AGRNO00468 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AGRNO00468 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
AGRNO00468 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms