Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
F8W8V4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
F8W8V4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
F8W8V4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
F8W8V4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
F8W8V4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
F8W8V4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
F8W8V4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
F8W8V4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
F8W8V4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
F8W8V4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
F8W8V4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
F8W8V4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
F8W8V4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
F8W8V4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
F8W8V4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
F8W8V4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
F8W8V4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
F8W8V4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
F8W8V4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
F8W8V4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
F8W8V4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
F8W8V4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
F8W8V4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
F8W8V4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F8W8V4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F8W8V4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
F8W8V4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
F8W8V4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
F8W8V4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
F8W8V4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
F8W8V4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
F8W8V4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
F8W8V4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
F8W8V4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
F8W8V4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
F8W8V4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
F8W8V4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8W8V4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8W8V4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8W8V4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8W8V4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
F8W8V4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
F8W8V4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
F8W8V4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
F8W8V4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
F8W8V4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
F8W8V4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
F8W8V4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
F8W8V4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
F8W8V4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
F8W8V4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
F8W8V4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
F8W8V4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
F8W8V4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F8W8V4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
F8W8V4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
F8W8V4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
F8W8V4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
F8W8V4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
F8W8V4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
F8W8V4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
F8W8V4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F8W8V4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W8V4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W8V4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
F8W8V4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
F8W8V4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
F8W8V4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
F8W8V4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
F8W8V4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
F8W8V4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8W8V4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8W8V4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W8V4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W8V4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
F8W8V4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8W8V4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8W8V4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8W8V4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W8V4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W8V4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W8V4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
F8W8V4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
F8W8V4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
F8W8V4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
F8W8V4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F8W8V4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F8W8V4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F8W8V4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8W8V4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8W8V4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8W8V4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8W8V4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8W8V4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8W8V4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F8W8V4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
F8W8V4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F8W8V4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
F8W8V4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms