Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8VVB4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VVB4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8VVB4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VVB4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VVB4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VVB4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VVB4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VVB4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VVB4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VVB4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VVB4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VVB4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VVB4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
F8VVB4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VVB4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VVB4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VVB4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VVB4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F8VVB4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
F8VVB4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F8VVB4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VVB4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VVB4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F8VVB4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F8VVB4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F8VVB4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F8VVB4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VVB4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8VVB4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F8VVB4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F8VVB4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F8VVB4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VVB4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VVB4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VVB4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VVB4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VVB4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VVB4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VVB4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VVB4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F8VVB4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F8VVB4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8VVB4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8VVB4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VVB4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
F8VVB4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VVB4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8VVB4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8VVB4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8VVB4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8VVB4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8VVB4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VVB4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VVB4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VVB4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VVB4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8VVB4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8VVB4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VVB4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8VVB4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VVB4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8VVB4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VVB4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VVB4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VVB4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VVB4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VVB4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F8VVB4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VVB4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8VVB4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VVB4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8VVB4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VVB4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8VVB4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8VVB4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8VVB4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
F8VVB4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F8VVB4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F8VVB4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8VVB4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8VVB4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8VVB4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VVB4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8VVB4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8VVB4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VVB4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F8VVB4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8VVB4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VVB4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VVB4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8VVB4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8VVB4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VVB4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VVB4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VVB4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VVB4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VVB4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VVB4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VVB4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms