Protein–RNA interactions for Protein: A2A288

ZC3H12D, Probable ribonuclease ZC3H12D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12DA2A288 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12DA2A288 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12DA2A288 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12DA2A288 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12DA2A288 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZC3H12DA2A288 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZC3H12DA2A288 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12DA2A288 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12DA2A288 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12DA2A288 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12DA2A288 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12DA2A288 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12DA2A288 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12DA2A288 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12DA2A288 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12DA2A288 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12DA2A288 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12DA2A288 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12DA2A288 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZC3H12DA2A288 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZC3H12DA2A288 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC3H12DA2A288 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC3H12DA2A288 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC3H12DA2A288 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC3H12DA2A288 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC3H12DA2A288 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZC3H12DA2A288 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC3H12DA2A288 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC3H12DA2A288 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC3H12DA2A288 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC3H12DA2A288 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZC3H12DA2A288 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZC3H12DA2A288 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZC3H12DA2A288 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZC3H12DA2A288 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZC3H12DA2A288 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZC3H12DA2A288 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZC3H12DA2A288 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZC3H12DA2A288 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZC3H12DA2A288 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZC3H12DA2A288 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12DA2A288 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12DA2A288 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12DA2A288 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12DA2A288 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12DA2A288 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12DA2A288 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12DA2A288 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12DA2A288 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12DA2A288 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12DA2A288 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12DA2A288 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12DA2A288 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12DA2A288 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12DA2A288 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12DA2A288 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12DA2A288 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12DA2A288 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZC3H12DA2A288 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12DA2A288 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms