Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N1

TRBV19, T-cell receptor beta variable 19 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV19A0A075B6N1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV19A0A075B6N1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV19A0A075B6N1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV19A0A075B6N1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV19A0A075B6N1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV19A0A075B6N1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV19A0A075B6N1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV19A0A075B6N1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV19A0A075B6N1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV19A0A075B6N1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV19A0A075B6N1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV19A0A075B6N1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV19A0A075B6N1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV19A0A075B6N1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV19A0A075B6N1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV19A0A075B6N1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV19A0A075B6N1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV19A0A075B6N1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV19A0A075B6N1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV19A0A075B6N1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV19A0A075B6N1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV19A0A075B6N1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV19A0A075B6N1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV19A0A075B6N1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV19A0A075B6N1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV19A0A075B6N1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV19A0A075B6N1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV19A0A075B6N1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV19A0A075B6N1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV19A0A075B6N1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV19A0A075B6N1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV19A0A075B6N1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV19A0A075B6N1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV19A0A075B6N1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV19A0A075B6N1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV19A0A075B6N1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV19A0A075B6N1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV19A0A075B6N1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV19A0A075B6N1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV19A0A075B6N1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV19A0A075B6N1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV19A0A075B6N1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV19A0A075B6N1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV19A0A075B6N1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV19A0A075B6N1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV19A0A075B6N1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV19A0A075B6N1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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