Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms