Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms