Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms