Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms