Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms