Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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