Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms