Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSPNQ9HAW4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms