Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms