Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA5Q9BWX5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms