Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC28BQ9BUN5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms