Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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