Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAT1Q99536 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms