Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms