Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAF2Q96CS3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms