Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCE1Q969G3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms