Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRN2Q92932 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRN2Q92932 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRN2Q92932 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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