Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCG3Q8WXD2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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