Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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