Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms