Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms