Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTOP1Q7RTM1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms