Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECW1Q76N89 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms