Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms